PhD-projekt om studiet af de molekylære mekanismer bag blomsterfarve og -mønstre.
Institut for Plante- og Miljøvidenskab (PLEN) inviterer ansøgere til et PhD-stipendium inden for AI-drevet videnekstraktion for plantemetabolisme.
Projektet er en del af Marie Skłodowska-Curie Actions Doctoral Network Stripes&Stars (aftale nr. 101312557), finansieret af Den Europæiske Union under Horizon Europe.
Stripes&Stars uddanner ti ph.d.-kandidater på tværs af otte europæiske lande i moderne forædling af pryd- og frugtafgrøder. Her bruges blomster- og frugtfarver – anthocyaniner og andre flavonoider i petunia, calibrachoa, julestjerne og blåbær – som videnskabeligt eksempel. Netværket samler syv modtagere (TU Wien, Klemm + Sohn, Università Campus Bio-Medico, Utrecht University, Københavns Universitet, Lantana Bio, UiT The Arctic University of Norway) og associerede partnere hos Galab, University of Helsinki, University of Amsterdam og Chulalongkorn University.
Om projektet.
Anthocyaniner repræsenterer et af de mest udbredte plantepigmenter, der giver anledning til de forskellige farver i frugter, grøntsager og blomster. Blomsterpigmentering er et kritisk træk, der vejleder tiltrækningen af bestøvere.
Nogle blomster udvikler bemærkelsesværdige mønstre gennem rumlig akkumulering af anthocyaniner i distinkte og gentagne mønstre. KU - SCIENCE - PLEN kender dog stadig ikke de molekylære mekanismer, der styrer blomstermønstrene.
Stillingen indebærer, at kandidaten vil:
- Udvikle en protoplast-pipeline til isolering af celler fra distinkte blomsterbladsmønstre.
- Kortlægge proteomerne fra forskellige celletyper.
- Anvende biotin-afhængig nærhedslabeling til at kortlægge proteingrupperne i anthocyaninbiosyntesevejen.
- Klarificere regulerende proteiner, der faciliterer anthocyaninvejens samling og nedbrydning.
Planlagte udstationeringer:
Udstationeringer omfatter Klemm (1 måned) for at indsamle plantemateriale fra blomsternes diversitetspanel. TU Wien (Prof. Heidi Halbwirth, 2 måneder) for protoplastoptimering til celleprøvetagning og ekspression af fusionskonstrukter. Lantana Bio (3 måneder) for at omsætte fund til at optimere en bioproduktionsproces af skræddersyede anthocyaniner i gær.
Kandidaten vil desuden deltage i netværkets træningsprogram med skoler, workshops og kurser i overførbare færdigheder.
Hvem søger KU - SCIENCE - PLEN?
KU - SCIENCE - PLEN søger kandidater inden for fagområderne biologi, kemi, biokemi, molekylærbiologi eller bioteknologi. Kandidaten skal ønske at blive en del af en dynamisk forskningsgruppe, der arbejder med plantebiokemi og biosyntese af specialiserede metabolitter.
Ansøgere kan have baggrund inden for opklaring/karakterisering af metaboliske veje, plantemolekylærbiologi/biokemi, metabolisk ingeniørkunst eller plantetransformation.
Vigtige videnskabelige værdier:
KU - SCIENCE - PLEN vil specifikt udvælge kandidater, der udviser et åbent mindset, evne til at samarbejde i forskningsteam og bidrage til et sundt arbejdsmiljø. Kandidaten opfordres til at kommunikere sin forskning åbent med en nysgerrighed over for forskellige synspunkter og discipliner.
MSCA-retningslinjer:
Stillingen er underlagt berettigelsesreglerne for Marie Skłodowska-Curie Doctoral Networks:
- Mobilitetsregel: Kandidaten må ikke have boet eller udført sin hovedaktivitet (arbejde, studier) i Danmark i mere end 12 måneder inden for de 36 måneder umiddelbart før ansættelsesdatoen.
- Kandidaten må ikke allerede besidde en doktorgrad på ansættelsesdatoen.
- Kandidaten kan have enhver nationalitet.
Forskningsgruppen og tilbud til kandidaten:
Den succesfulde ansøger vil blive en del af Tomas Laursen og forskningsgruppen Dynamic Metabolons. Gruppen specialiserer sig i organiseringen af biosyntetiske veje til produktion af bioaktive forbindelser. Forskningsgruppen kombinerer mikroskopi, metabolomics og proteomics med fundamental biokemi for at studere biosyntesen af specialiserede plantemetabolitter fra enkeltenzym- til hele planteniveauet.
Forskningsgruppen Dynamic Metabolons er en del af Institut for Plante- og Miljøvidenskab. Instituttet huser fire sektioner, der spænder fra molekylærbiologi til afgrødevidenskab og miljøkemi. KU - SCIENCE - PLEN tilbyder kreative og stimulerende arbejdsforhold i et dynamisk og internationalt forskningsmiljø. Forskningsfaciliteterne omfatter moderne laboratorier, plantevækstfaciliteter og en metabolomicsplatform, der er placeret inden for sektionen.
Hovedvejleder er lektor Tomas Laursen, tola@plen.ku.dk.
PhD-uddannelsen:
Der er tale om et treårigt fuldtidsstudie inden for rammerne af det almindelige PhD-program (5+3-ordningen), hvis kandidaten allerede har en uddannelse svarende til en relevant dansk kandidatgrad.
Kvalifikationer til programmet:
For at være berettiget til PhD-programmet skal kandidaten have afsluttet en uddannelse, der svarer til en dansk kandidatgrad (180 ECTS/3 FTE BSc + 120 ECTS/2 FTE MSc), inden for projektets fagområde, f.eks. kemi, biokemi eller molekylærbiologi.
For information om berettigelse af afsluttede uddannelser henvises til Generelle vurderinger for specifikke lande og Vurderingsdatabase.
Ansættelsesvilkår i det almindelige program:
Ansættelse som PhD-stipendiat er på fuld tid og for maksimalt 3 år.
Ansættelsen er betinget af kandidatens succesfulde indskrivning som PhD-studerende ved PhD-skolen på Det Natur- og Biovidenskabelige Fakultet, Københavns Universitet. Dette kræver indsendelse og accept af en ansøgning til det specifikke projekt, formuleret af ansøgeren.
Ansættelsesvilkår og løn er i overensstemmelse med overenskomsten mellem Finansministeriet og Akademikerne (AC) for akademikere i staten. Stillingen er omfattet af Protokol om Stillingsstruktur.
Ansvar og opgaver i PhD-programmet:
- Udføre et selvstændigt forskningsprojekt under vejledning.
- Gennemføre PhD-kurser svarende til ca. 30 ECTS / ½ årsværk.
- Deltage i aktive forskningsmiljøer, herunder et ophold ved en anden forskningsinstitution, fortrinsvis i udlandet.
- Varetage undervisnings- og vidensformidlingsaktiviteter.
- Skrive videnskabelige artikler rettet mod tidsskrifter med høj impact.
- Skrive og forsvare en PhD-afhandling baseret på projektet.
KU - SCIENCE - PLEN søger følgende kvalifikationer:
- Faglige kvalifikationer relevante for PhD-projektet.
- Relevante publikationer.
- Relevant erhvervserfaring.
- Andre relevante faglige aktiviteter.
- Nysgerrigt mindset med stærk interesse for forskningsfeltet.
- Fremragende engelskkundskaber.
Ansøgning og vurderingsprocedure:
Ansøgningen inklusive alle bilag skal være på engelsk og indsendes elektronisk.
Ansøgningen skal indeholde:
- Motiveret ansøgning, herunder eventuelle præferencer for arbejde med biosyntese eller transport.
- Curriculum vitae med information om kandidatens uddannelse, erfaring, sprogfærdigheder og andre relevante færdigheder for stillingen.
- Originale eksamensbeviser for bachelor- og kandidatgrader samt karakterudskrifter på originalsproget, herunder en autoriseret engelsk oversættelse, hvis de er udstedt på et andet sprog end engelsk eller dansk. Hvis den seneste grad ikke er afsluttet, bedes en certificeret/underskrevet kopi af en nylig karakterudskrift og en skriftlig erklæring fra institutionen eller vejlederen medsendes.
- Publikationsliste (hvis muligt).
- Referencer (hvis tilgængelige).
Ansøgningsfrist:
Fristen for ansøgninger er 31. januar 2027, kl. 23:59 GMT+1.
KU - SCIENCE - PLEN forbeholder sig retten til ikke at behandle materiale modtaget efter fristen, og til ikke at behandle ansøgninger, der ikke opfylder ovennævnte krav.
Den videre proces:
Efter fristen vil et antal ansøgere blive udvalgt til faglig vurdering af en uvildig ekspertbedømmer. Ansøgerne vil blive underrettet, om de er udvalgt til vurdering.
Bedømmeren vil vurdere de udvalgte ansøgeres kvalifikationer og erfaringer med hensyn til det ovenfor nævnte forskningsområde, teknikker, færdigheder og andre krav. Bedømmeren vil konkludere, om hver ansøger er kvalificeret og, i så fald, til hvilken af de to modeller. De vurderede ansøgere vil få mulighed for at kommentere deres vurdering. Information om rekrutteringsprocessen kan findes på http://employment.ku.dk/faculty/recruitment-process/.
Interviews med udvalgte kandidater forventes afholdt i uge 1. april 2025.
Spørgsmål:
For specifik information om PhD-stipendiet kan interesserede kontakte hovedvejlederen.
Generel information om PhD-studier på Det Natur- og Biovidenskabelige Fakultet er tilgængelig på PhD-skolens hjemmeside: https://www.science.ku.dk/phd/.
Københavns Universitet ønsker at afspejle det omgivende samfund og inviterer alle til at ansøge uanset personlig baggrund.
